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 O Instituto investe em tecnologia de ponta, através dos projetos de desenvolvimento conjunto com parceiros nacionais e internacionais. É importante ressaltar a comunhão de interesses entre as áreas de desenvolvimento tecnológico e produção, que fortalece os objetivos de melhoria da capacidade da unidade de atender à demanda nacional de saúde pública e a sua vocação como agente de inovação tecnológica.
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Parcerias com outras unidades Fiocruz
 Centro de Criação de Animais de Laboratório (Cecal)
Centro de Pesquisa Aggeu Magalhães (CPqAM/PE)
Centro de Pesquisa Gonçalo Muniz (CPqGM/BA)
Centro de Pesquisa Renné Rachou (CPqRR/MG)
Escola Nacional de Saúde Pública (Ensp)
Instituto Oswaldo Cruz (IOC)
Instituto de Pesquisa Clínica Evandro Chagas (Ipec)
Instituto de Tecnologia em Fármacos (Farmanguinhos)
Parcerias com outras instituições
Fundação Ezequiel Dias (Funed/MG)
Instituto Adolfo Lutz (IAL/SP)
Instituto de Biologia Molecular do Paraná (IBMP/PR)
Instituto Nacional do Câncer (Inca)
Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)
Coordenação dos Programas de Pós-Graduação em Engenharia (Coppe/UFRJ)
Universidade Federal do Estado de São Paulo (Unifesp)
Universidade do Estado do Rio de Janeiro (Uerj)
Universidade de Brasília (UnB)
 Centro de Ingeniería Genética y Biotecnología (CIGB)
Centro de Imunologia Molecular (CIM)
Instituto Finlay
 Chembio Diagnostics Inc.
 GlaxoSmithKline
 Instituto Biken
Japan Poliomyelitis Research Institute (JPRI)
Fraunhofer
 Sanofi Pasteur
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Inovação 
